48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2326 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 254 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  63.9 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  36.21 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 285 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  34.91 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 314 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  36.73 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 602 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.2 
 
 		 550 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 453 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 573 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.84 
 
 		 733 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  22.62 
 
 		 350 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  32.14 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 754 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 718 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 457 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 		 875 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.15 
 
 		 725 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  33.85 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 3145 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 754 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 732 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 589 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14685  predicted protein  34.85 
 
 		 332 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.214981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 833 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>