20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2761 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.59 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  27.94 
 
 
301 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  36.78 
 
 
293 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  27.15 
 
 
302 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  24.71 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  31.09 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  36.46 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
556 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
453 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  46.77 
 
 
700 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>