60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0140 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0140  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
470 aa  919    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.207647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
258 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.86 
 
 
782 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.61 
 
 
784 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.61 
 
 
818 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 
833 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.25 
 
 
1056 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 
988 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1281  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
816 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 
1040 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.25 
 
 
850 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1056 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.38 
 
 
1022 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
628 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 
296 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
614 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.28 
 
 
626 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
178 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
804 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 
614 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 
614 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0352  UDP-n-acetylglucosamine-peptide-n- acetylglucosaminyltransferase  28.79 
 
 
538 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.505305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1909  aerotolerance protein  32.11 
 
 
237 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.12502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
614 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.28 
 
 
626 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
614 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
174 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.69 
 
 
576 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  30 
 
 
992 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 
214 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15331  hypothetical protein  40.28 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.01 
 
 
2145 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.23 
 
 
1154 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 
549 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 
985 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
684 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
649 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  29.23 
 
 
773 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
706 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  30.86 
 
 
1006 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
809 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  30.21 
 
 
407 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.17 
 
 
836 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
687 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
174 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.95 
 
 
1404 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
571 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.6 
 
 
740 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
467 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38886  predicted protein  27.91 
 
 
648 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
750 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.58 
 
 
1550 aa  43.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  35.56 
 
 
319 aa  43.5  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.09 
 
 
689 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>