More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38886 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38886  predicted protein  100 
 
 
648 aa  1345    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08013  20S cyclosome subunit (APC8), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02440)  32.01 
 
 
672 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380459  normal  0.107376 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35663  predicted protein  37.89 
 
 
502 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00548899  normal  0.928712 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05740  Cell division control protein 23, putative  30.2 
 
 
626 aa  262  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326948  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63396  predicted protein  30.05 
 
 
551 aa  237  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  30.59 
 
 
375 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  28.17 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  31.31 
 
 
571 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  24.82 
 
 
336 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06138  Protein bimA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17885]  32.82 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112787  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.36 
 
 
730 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
878 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.65 
 
 
810 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.4 
 
 
707 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
3145 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
927 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.5 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 
833 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1694 aa  67.4  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
329 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 
2240 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.26 
 
 
620 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  26.35 
 
 
612 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  31.01 
 
 
1101 aa  64.3  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
1486 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
512 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
1371 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
465 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
243 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
220 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
3035 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.75 
 
 
887 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 
572 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
265 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 
620 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 
436 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
1154 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1297 aa  61.6  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
409 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
244 aa  61.6  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  21.88 
 
 
661 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.45 
 
 
733 aa  61.6  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
515 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
566 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
602 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
409 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 
589 aa  60.8  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.35 
 
 
397 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 
564 aa  60.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
409 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
543 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.1 
 
 
407 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.06 
 
 
626 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 
314 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.6 
 
 
725 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
573 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 
689 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
4079 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.52 
 
 
1737 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
743 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
673 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  24.22 
 
 
508 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 
639 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
716 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
708 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.7 
 
 
573 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
279 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.19 
 
 
573 aa  58.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
1252 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  25.35 
 
 
815 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
750 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25 
 
 
1007 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
1252 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 
250 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1276 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
1406 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 
233 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.95 
 
 
784 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
594 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.91 
 
 
622 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
739 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  27.7 
 
 
503 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  20.38 
 
 
1827 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.24 
 
 
267 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.98 
 
 
937 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
280 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.48 
 
 
758 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
448 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.01 
 
 
708 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 
1034 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
289 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
1094 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>