194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3086 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 579 aa  1147    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  34.17 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  34.96 
 
 		 658 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  35.97 
 
 		 572 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  38.6 
 
 		 578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 701 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 612 aa  273  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 588 aa  270  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  35.17 
 
 		 572 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  38.01 
 
 		 585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  36.27 
 
 		 577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  37.08 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 664 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 572 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 644 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  36.11 
 
 		 572 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 		 572 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 571 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 657 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  29.67 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 		 612 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  32.28 
 
 		 679 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 650 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 693 aa  226  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.82 
 
 		 690 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 517 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 690 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 663 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  36.57 
 
 		 701 aa  220  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 681 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 687 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 690 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  34.46 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 692 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 691 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  34.37 
 
 		 599 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.55 
 
 		 692 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  35.14 
 
 		 646 aa  212  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 587 aa  210  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 693 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 653 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  31.73 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.47 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  27.77 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.44 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  23.9 
 
 		 576 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.84 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.99 
 
 		 573 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.63 
 
 		 573 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  29.52 
 
 		 310 aa  124  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 573 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  29.21 
 
 		 310 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.65 
 
 		 595 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.23 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  33.74 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 		 345 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 		 335 aa  92  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  37.29 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.16 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  38.14 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.32 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  35.84 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.05 
 
 		 320 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 		 347 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.08 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 312 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  31.9 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.69 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  32.9 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.68 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  27.17 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  22.81 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 333 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>