100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0440 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2668  Tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121985  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2350  hypothetical protein  32.1 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 810 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.19 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 681 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.97 
 
 		 622 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.12 
 
 		 795 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1276 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.32 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  35.96 
 
 		 587 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 836 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 909 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 685 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 739 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 878 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 362 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2115  hypothetical protein  30.86 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463598  normal  0.981842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 955 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 		 566 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  32.04 
 
 		 734 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 452 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 612 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.88 
 
 		 816 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 955 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 611 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  29.84 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 688 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 635 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 635 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 632 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1276 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 764 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 543 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.58 
 
 		 1694 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 636 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.38 
 
 		 626 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.17 
 
 		 573 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 624 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 298 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.95 
 
 		 707 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 605 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  36.49 
 
 		 733 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1450 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 754 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  23.72 
 
 		 1240 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  35.71 
 
 		 545 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 		 626 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 637 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 		 626 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0105  hypothetical protein  33.66 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 754 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 1737 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.73 
 
 		 887 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 686 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 1406 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.4 
 
 		 865 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 780 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 448 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 620 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 750 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 1252 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.36 
 
 		 725 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 1252 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.77 
 
 		 1007 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.73 
 
 		 603 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  29.31 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 974 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 767 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 711 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 637 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.45 
 
 		 620 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.36 
 
 		 1154 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 566 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 523 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 921 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 366 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 533 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 639 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 714 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6772  heat shock protein DnaJ domain protein  32.14 
 
 		 645 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 406 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 808 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 406 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>