73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1388 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 298 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  87.74 
 
 		 301 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.72 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.6 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  56.23 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  56.73 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.49 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 612 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 572 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  35.66 
 
 		 572 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 571 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  33.07 
 
 		 224 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 572 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  32.65 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 664 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  34.15 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.85 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.69 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 647 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  40.24 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  46.46 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  33.91 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 644 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  36.26 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  42.03 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  32.23 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  42.19 
 
 		 690 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  42.47 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  38.67 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 693 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  40.51 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 522 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  42.11 
 
 		 530 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  30.58 
 
 		 585 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.3 
 
 		 517 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 		 576 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.8 
 
 		 599 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 690 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.16 
 
 		 692 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 692 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 680 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 658 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  37.33 
 
 		 601 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.8 
 
 		 607 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 693 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  43.86 
 
 		 691 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  37.66 
 
 		 544 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 		 586 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  42.19 
 
 		 701 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 465 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3281  hypothetical protein  42.05 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 707 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1138 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.88 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.08 
 
 		 560 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 927 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.47 
 
 		 439 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 573 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>