25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1130 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  51.35 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3281  hypothetical protein  51.22 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  45.65 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.2 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 		 544 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 		 658 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 612 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  35.42 
 
 		 577 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 522 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 517 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  32.47 
 
 		 667 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  36.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  26.11 
 
 		 531 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 543 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  36.92 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.44 
 
 		 784 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  25.7 
 
 		 503 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>