19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3281 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3281  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116552  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  98.48 
 
 		 198 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  50.25 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  47.47 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  34.3 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.66 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 572 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.17 
 
 		 572 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 612 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.1 
 
 		 658 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32.77 
 
 		 577 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  27.22 
 
 		 544 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 653 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>