203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3802 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1056    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.97 
 
 		 517 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  48.6 
 
 		 544 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  46.9 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  41.33 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  35.27 
 
 		 658 aa  276  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 701 aa  276  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  35.82 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 		 647 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 		 679 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.85 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 664 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 644 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 690 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 681 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 687 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 663 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 690 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  31.46 
 
 		 690 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 692 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.42 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 571 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  32.14 
 
 		 667 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 692 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 572 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 650 aa  216  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 		 572 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 693 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 		 573 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 612 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30.19 
 
 		 572 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.81 
 
 		 573 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 657 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 		 573 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 693 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  33.55 
 
 		 701 aa  203  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.29 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 653 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.04 
 
 		 619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  34.83 
 
 		 579 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  31.01 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 586 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.98 
 
 		 601 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  34.43 
 
 		 578 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  26.48 
 
 		 564 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 680 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  32.73 
 
 		 607 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  31.06 
 
 		 646 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  32.01 
 
 		 585 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  37.27 
 
 		 304 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  27.36 
 
 		 310 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  34.81 
 
 		 310 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 335 aa  110  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.38 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 220 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 611 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.65 
 
 		 471 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 345 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.81 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 		 339 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 651 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.11 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  38.24 
 
 		 278 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  22.67 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  40.86 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  26.73 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  35.03 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  20.59 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.74 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.86 
 
 		 351 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  29.6 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  30.57 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>