195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000305 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  100 
 
 
576 aa  1182    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  53.29 
 
 
573 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  53.11 
 
 
573 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  53.46 
 
 
573 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.67 
 
 
531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 
544 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
522 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 
517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  29.69 
 
 
503 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  33.56 
 
 
530 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
533 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
647 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
701 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.13 
 
 
658 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  28.93 
 
 
564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 
679 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
664 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
572 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
644 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
663 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.07 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
690 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
692 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
690 aa  161  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
693 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.68 
 
 
572 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 
572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
681 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
687 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
572 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
690 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.8 
 
 
607 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 
691 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
650 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  26.97 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  26.71 
 
 
701 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
588 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 
572 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  27.59 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  34.52 
 
 
304 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.45 
 
 
578 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.54 
 
 
601 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.1 
 
 
619 aa  134  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
653 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
680 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
693 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.8 
 
 
310 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  28.48 
 
 
310 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
612 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.55 
 
 
599 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 
586 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  26.42 
 
 
577 aa  117  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  23.65 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  27.84 
 
 
585 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
587 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
344 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
339 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.67 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  38.4 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
335 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 
651 aa  72.4  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  34.26 
 
 
611 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 
336 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  32.61 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
316 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.37 
 
 
334 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 
334 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  20.44 
 
 
346 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  31.48 
 
 
344 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.9 
 
 
358 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  38.79 
 
 
339 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 
358 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 
328 aa  64.7  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
358 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.46 
 
 
320 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
337 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  25.59 
 
 
321 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.65 
 
 
333 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.03 
 
 
349 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 
319 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  22.87 
 
 
335 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  25.35 
 
 
319 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  23.49 
 
 
320 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  23 
 
 
332 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 
315 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
340 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.89 
 
 
320 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>