181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3163 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1395    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 647 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  37.28 
 
 		 667 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 701 aa  360  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 644 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 650 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  37.08 
 
 		 679 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 		 701 aa  331  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 663 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 		 657 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 690 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 690 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 693 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 692 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 664 aa  300  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 681 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 687 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.29 
 
 		 692 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 693 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 691 aa  293  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 653 aa  281  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  33.79 
 
 		 619 aa  266  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  33.07 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  32.4 
 
 		 601 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 612 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 522 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.64 
 
 		 607 aa  230  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 517 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 572 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 572 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  28.51 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 571 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  26.22 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  30.29 
 
 		 577 aa  196  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.81 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.3 
 
 		 585 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.85 
 
 		 576 aa  180  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 612 aa  177  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 680 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  25.62 
 
 		 531 aa  170  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 573 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  26.4 
 
 		 503 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.17 
 
 		 595 aa  137  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  37.86 
 
 		 310 aa  134  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  37.38 
 
 		 310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  32.13 
 
 		 578 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.89 
 
 		 611 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.83 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 		 320 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 345 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.42 
 
 		 344 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.33 
 
 		 339 aa  91.3  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.29 
 
 		 651 aa  88.2  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  28.04 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  46.88 
 
 		 293 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  47.31 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 336 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  32.24 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.58 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 		 589 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  41.77 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  26.55 
 
 		 319 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 		 349 aa  63.9  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  49.23 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.15 
 
 		 327 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 334 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 		 318 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  32.5 
 
 		 335 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  34.42 
 
 		 335 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  34.04 
 
 		 754 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 		 339 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 		 337 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 339 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  26.33 
 
 		 333 aa  52.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 		 339 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  30.59 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>