172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0853 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1299    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  36.34 
 
 		 647 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 701 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  32.23 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 650 aa  230  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 		 679 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 663 aa  226  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 612 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  32.48 
 
 		 607 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 664 aa  207  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 522 aa  207  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 690 aa  207  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  34.27 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 690 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 681 aa  200  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 687 aa  200  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 692 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 692 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 691 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  30.27 
 
 		 667 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  34.62 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 690 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 693 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.88 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  36.67 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  28.94 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 693 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 588 aa  170  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.3 
 
 		 601 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.48 
 
 		 646 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  33.6 
 
 		 585 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  33.59 
 
 		 531 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.33 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.46 
 
 		 530 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.54 
 
 		 517 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.73 
 
 		 599 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  30.98 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  35.57 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  31.65 
 
 		 310 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  31.65 
 
 		 310 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.89 
 
 		 564 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  38.14 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  38.14 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  37.64 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 		 651 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 273 aa  80.1  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  21.51 
 
 		 595 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  32.2 
 
 		 329 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.02 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.37 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  48.05 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 312 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 		 340 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  32.53 
 
 		 299 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.84 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.46 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.61 
 
 		 2449 aa  61.2  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.1 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  23.38 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.57 
 
 		 338 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.37 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.52 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  25.35 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>