158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0072 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 664 aa  1350    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 647 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  36.36 
 
 		 679 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 701 aa  296  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 644 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 663 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 690 aa  276  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 650 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  30.91 
 
 		 667 aa  267  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 690 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 681 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 687 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.75 
 
 		 692 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  36.38 
 
 		 692 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  32.46 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 701 aa  257  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  31.88 
 
 		 658 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 693 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 693 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 		 690 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 691 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30.78 
 
 		 572 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 572 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 571 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  34.31 
 
 		 599 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  31.48 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 653 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  31.8 
 
 		 578 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  34.04 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 572 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 612 aa  226  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  33.1 
 
 		 646 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  31.49 
 
 		 530 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 588 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.94 
 
 		 585 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  32.52 
 
 		 531 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  30.33 
 
 		 619 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 		 544 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  29.95 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.69 
 
 		 579 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.12 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.28 
 
 		 607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.74 
 
 		 576 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 533 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.57 
 
 		 564 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 573 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  34.48 
 
 		 310 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  29.79 
 
 		 310 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.78 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.16 
 
 		 611 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.09 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 312 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  22.17 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 335 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.77 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  23.71 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  33.59 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  34.38 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 338 aa  63.9  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 		 754 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.85 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 		 315 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  20.85 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.91 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.09 
 
 		 345 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  24.85 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  22.63 
 
 		 343 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 319 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 339 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  31.65 
 
 		 335 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  34.02 
 
 		 319 aa  54.3  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.99 
 
 		 327 aa  53.9  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 		 316 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  36.54 
 
 		 377 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  21.93 
 
 		 334 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  33.71 
 
 		 326 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.9 
 
 		 321 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>