189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1107 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1285    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  44.84 
 
 		 619 aa  389  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  45.64 
 
 		 601 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  44.04 
 
 		 599 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 657 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 644 aa  328  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  40.97 
 
 		 679 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  40.55 
 
 		 701 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 650 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 692 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 701 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 		 663 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 		 690 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 647 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.75 
 
 		 692 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 690 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  41.63 
 
 		 681 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  41.63 
 
 		 687 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 693 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 		 658 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 693 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 653 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 691 aa  257  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  34.82 
 
 		 690 aa  250  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 664 aa  249  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 612 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.23 
 
 		 607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 579 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  36.79 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  36.48 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  36.29 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  35.51 
 
 		 572 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 572 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 587 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  36.67 
 
 		 586 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 571 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  33 
 
 		 585 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  39.11 
 
 		 667 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 522 aa  186  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  30.8 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.09 
 
 		 576 aa  164  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 612 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  30.14 
 
 		 531 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 		 595 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 		 573 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.88 
 
 		 503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  34.2 
 
 		 310 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 611 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  33.68 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.07 
 
 		 564 aa  112  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.9 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 		 651 aa  107  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  37.21 
 
 		 304 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 		 335 aa  102  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 345 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 334 aa  90.9  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 347 aa  88.6  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 339 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.44 
 
 		 339 aa  87.4  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 320 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.82 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.71 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.88 
 
 		 346 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 		 337 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  27.46 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.6 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  24.79 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 349 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  25.98 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  23.53 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  31.12 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>