40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0723 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02120  BatE, TRP domain containing protein  40.83 
 
 
249 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1485  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228299  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_002950  PG1586  batE protein  31.76 
 
 
302 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  28.63 
 
 
252 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1119  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  44.74 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  44.74 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2458  protein of unknown function DUF1058  24.33 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.895982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.56 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
714 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
955 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
3035 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.27 
 
 
1694 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
878 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
740 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
595 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
543 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 
576 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
810 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.8 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.66 
 
 
714 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
4489 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
467 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
927 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
697 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
657 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
573 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  24.22 
 
 
645 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  35.29 
 
 
1764 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  25.95 
 
 
1014 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
700 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
1038 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
3560 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
804 aa  42  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
1406 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>