100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1119 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1119  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1485  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228299  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02120  BatE, TRP domain containing protein  26.53 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
784 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2458  protein of unknown function DUF1058  25.69 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.895982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
818 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.62 
 
 
632 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 
404 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
878 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
161 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  36.9 
 
 
576 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 
810 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.67 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.67 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.24 
 
 
560 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 
626 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  22.96 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
441 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 
441 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
1737 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.08 
 
 
1056 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.18 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0023  tetratricopeptide TPR_2  36.67 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.35 
 
 
1022 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  38.2 
 
 
581 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
547 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
668 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0002  tetratricopeptide TPR_2  27.63 
 
 
128 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00992655  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
637 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0134  tetratricopeptide repeat domain protein  33.75 
 
 
375 aa  45.8  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  32.53 
 
 
471 aa  45.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
146 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
686 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  30.38 
 
 
734 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
649 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
589 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
626 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
611 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
605 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3035 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
626 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
635 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
635 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
3145 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.24 
 
 
569 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
266 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.12 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 
1056 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.03 
 
 
820 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
639 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
629 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.12 
 
 
539 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
392 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
246 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
4489 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
593 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
592 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
636 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
927 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  34.29 
 
 
795 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
502 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
391 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 
652 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 
617 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
652 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
395 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
612 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
652 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 
565 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
543 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
804 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.72 
 
 
620 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.31 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
847 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
601 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  31.75 
 
 
191 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
573 aa  42  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
412 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
988 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  34.12 
 
 
666 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.71 
 
 
542 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 
1213 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 
149 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
312 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>