More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0023 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0023  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  55.07 
 
 
734 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  47.62 
 
 
442 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 
878 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.42 
 
 
622 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.47 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1061 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  39.8 
 
 
1213 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.69 
 
 
725 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.69 
 
 
632 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
750 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  50.85 
 
 
955 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  38.36 
 
 
676 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  45.59 
 
 
1737 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.54 
 
 
441 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  47.54 
 
 
441 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  44.62 
 
 
875 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  40.26 
 
 
2059 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  47.54 
 
 
764 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  45.59 
 
 
3172 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
1085 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.54 
 
 
737 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
448 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
1486 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 
486 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  35.11 
 
 
682 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
3145 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 
637 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  42.05 
 
 
887 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  52.73 
 
 
289 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 
828 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  45.07 
 
 
681 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
732 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.33 
 
 
784 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.53 
 
 
535 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
847 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  46.48 
 
 
685 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
824 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 
828 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
718 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  38.67 
 
 
681 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 
732 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 
3035 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
308 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3927  hypothetical protein  30.56 
 
 
379 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.718732  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  41.07 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35 
 
 
818 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 
833 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2953  hypothetical protein  45.45 
 
 
328 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0105956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  39.34 
 
 
560 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.04 
 
 
1694 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
1252 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3179  hypothetical protein  45.45 
 
 
328 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
1252 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
3301 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
1192 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  40 
 
 
462 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 
576 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  40 
 
 
661 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  34.78 
 
 
623 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  39.29 
 
 
733 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1346  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.068712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
289 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
573 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
649 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
602 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  36.76 
 
 
832 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1197  hypothetical protein  43.64 
 
 
320 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.5811  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  40.85 
 
 
865 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
892 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  45 
 
 
909 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 
270 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
617 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  44.44 
 
 
587 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 
270 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
754 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  43.86 
 
 
427 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 
833 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.76 
 
 
620 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  41.67 
 
 
820 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
836 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
363 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
374 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
221 aa  51.6  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 
754 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
543 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 
645 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.94 
 
 
988 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.33 
 
 
1056 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
591 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
594 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
639 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
4079 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 
601 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
421 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
477 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  39.71 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>