13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0670 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1485  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228299  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02120  BatE, TRP domain containing protein  33.07 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1586  batE protein  27.83 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  36.62 
 
 		 1014 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1119  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  35.53 
 
 		 979 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2458  protein of unknown function DUF1058  27.74 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.895982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 804 aa  45.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.51 
 
 		 1979 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 393 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>