26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1776 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 804 aa  1647    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  28.93 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  28.43 
 
 		 572 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  23.43 
 
 		 600 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  28.64 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  29.84 
 
 		 455 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  23.8 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.46 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  27.67 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  29.75 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  33.33 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  23.62 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  24.83 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  23.05 
 
 		 447 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  29.61 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  27.82 
 
 		 871 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  20.83 
 
 		 576 aa  51.6  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  27.07 
 
 		 486 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  20.47 
 
 		 465 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 251 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 651 aa  47  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.36 
 
 		 201 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  31.33 
 
 		 700 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 243 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0670  SH3 type 3 domain protein  24.5 
 
 		 252 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32.89 
 
 		 577 aa  44.3  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>