37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1679 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  926    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  35.79 
 
 		 447 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  33.98 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  33.08 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  29.56 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  29.01 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  30.74 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  26.34 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  26.32 
 
 		 614 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  28.32 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  28.06 
 
 		 584 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  24.46 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  30.28 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 804 aa  70.1  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  23.35 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.96 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  26.88 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  26.19 
 
 		 871 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  28.68 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  28.89 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  27.31 
 
 		 546 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  27.63 
 
 		 568 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  19.61 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  26.62 
 
 		 564 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  26.62 
 
 		 564 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  26.62 
 
 		 569 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  25.08 
 
 		 555 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  26.28 
 
 		 544 aa  46.6  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25.97 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  21.56 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  26.86 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 		 897 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  26.67 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.69 
 
 		 611 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 553 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  25.36 
 
 		 581 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>