33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0722 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  1197    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  51.37 
 
 
589 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  47.29 
 
 
584 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  33.22 
 
 
614 aa  296  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  29.88 
 
 
600 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  27.89 
 
 
659 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  28.15 
 
 
572 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  25.06 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  27.84 
 
 
452 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  28.06 
 
 
454 aa  97.1  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  94.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  26.64 
 
 
438 aa  90.9  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.32 
 
 
585 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  22.1 
 
 
601 aa  77  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  23.5 
 
 
447 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  23.97 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  24.04 
 
 
486 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.66 
 
 
611 aa  67  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 
897 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  23.17 
 
 
871 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  25.38 
 
 
446 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
804 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  21.46 
 
 
465 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  25.2 
 
 
455 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.01 
 
 
595 aa  57.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  23.34 
 
 
571 aa  54.3  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  23.33 
 
 
570 aa  53.9  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  20.68 
 
 
580 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  20.85 
 
 
543 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  20.33 
 
 
543 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.63 
 
 
549 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  22.63 
 
 
549 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  21.65 
 
 
546 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>