23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2467 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  929    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  38.73 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  37.41 
 
 
443 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  33.08 
 
 
454 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  32.48 
 
 
438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  30.99 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  26.95 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  26.79 
 
 
614 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  24.2 
 
 
589 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  27.84 
 
 
584 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  27.3 
 
 
659 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  25 
 
 
572 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  25.54 
 
 
584 aa  87.8  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  23.81 
 
 
601 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  29.66 
 
 
871 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
804 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  24.12 
 
 
576 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  28.35 
 
 
455 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  26.76 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 
897 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  22.35 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  22.35 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0169  hypothetical protein  25.98 
 
 
667 aa  44.3  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000510437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>