44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1484 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1261    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  35.96 
 
 
584 aa  333  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  35.1 
 
 
600 aa  322  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  33.39 
 
 
589 aa  316  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  30.56 
 
 
659 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  33.22 
 
 
584 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  28.7 
 
 
572 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  24.57 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  24.89 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  26.79 
 
 
452 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.32 
 
 
454 aa  107  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  28.8 
 
 
447 aa  97.4  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  29 
 
 
443 aa  93.6  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  26.16 
 
 
438 aa  90.9  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  23.13 
 
 
465 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
804 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  23.68 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  20.43 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  24.66 
 
 
871 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  24.91 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  22.25 
 
 
611 aa  67.4  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  27.66 
 
 
455 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  22.76 
 
 
546 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  26.57 
 
 
446 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  22.5 
 
 
586 aa  61.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  22.22 
 
 
544 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  21.46 
 
 
543 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  21.62 
 
 
543 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  21.98 
 
 
543 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  21.09 
 
 
541 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  23.2 
 
 
447 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  22.31 
 
 
543 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.03 
 
 
897 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  23.64 
 
 
580 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  21.72 
 
 
595 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  20.83 
 
 
584 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  21.62 
 
 
570 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.04 
 
 
585 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  21.93 
 
 
555 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  20.53 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  21.53 
 
 
553 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  22.05 
 
 
546 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  21.53 
 
 
553 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  20.9 
 
 
552 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>