65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0439 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1120    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  26.02 
 
 
614 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  24.26 
 
 
589 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  25.25 
 
 
584 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  26.26 
 
 
584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  26.06 
 
 
600 aa  137  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  25.54 
 
 
659 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  27.06 
 
 
454 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  26.73 
 
 
436 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  22.6 
 
 
452 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  25.86 
 
 
447 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  27.59 
 
 
438 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  29.3 
 
 
443 aa  93.6  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  25.18 
 
 
601 aa  88.2  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  24.84 
 
 
544 aa  87  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  19.04 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  43.44 
 
 
871 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
804 aa  83.6  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  21.67 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  26.24 
 
 
595 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.95 
 
 
549 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.16 
 
 
549 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  29.72 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  23.01 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  32.54 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  23.4 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  22.38 
 
 
564 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  22.59 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  27.05 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  27.37 
 
 
544 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.37 
 
 
543 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  27.32 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.16 
 
 
543 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  20.44 
 
 
486 aa  63.9  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.98 
 
 
543 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.01 
 
 
551 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25.98 
 
 
543 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  24.2 
 
 
586 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  28.19 
 
 
544 aa  60.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.55 
 
 
546 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  23.38 
 
 
555 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.76 
 
 
581 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  23.95 
 
 
584 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  25.32 
 
 
546 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  20.98 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  22.93 
 
 
547 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  23.33 
 
 
546 aa  57  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  22.35 
 
 
548 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  22.85 
 
 
566 aa  51.2  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  25.07 
 
 
552 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  22.22 
 
 
552 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  22.46 
 
 
553 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25.68 
 
 
541 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.08 
 
 
611 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  22.16 
 
 
553 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  21.76 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  31.25 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  26.36 
 
 
585 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  25.51 
 
 
458 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  23.34 
 
 
586 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 
897 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  22.72 
 
 
548 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.18 
 
 
571 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  28.65 
 
 
389 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  26.63 
 
 
589 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>