14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0658 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  981    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  23.68 
 
 
614 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  24.45 
 
 
584 aa  70.1  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  24.24 
 
 
589 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  20.34 
 
 
572 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0650  hypothetical protein  32.28 
 
 
371 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  24.13 
 
 
584 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  24.36 
 
 
600 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
804 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  22.45 
 
 
576 aa  50.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  22.87 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  21.54 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  23.08 
 
 
601 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  27.66 
 
 
659 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>