28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0669 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1352    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  31.56 
 
 		 614 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  30.44 
 
 		 600 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  28.46 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  28.88 
 
 		 584 aa  243  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  28.04 
 
 		 584 aa  210  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  23.47 
 
 		 572 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  23.05 
 
 		 601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  22.02 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  24.02 
 
 		 452 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  29.66 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  28.97 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.19 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 804 aa  75.1  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  24.48 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  23.13 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  29.17 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  19.53 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  21.19 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  29.6 
 
 		 871 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  22.56 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  21.27 
 
 		 611 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.38 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  21.92 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  29.01 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  21.6 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  23.5 
 
 		 580 aa  43.9  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>