18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2358 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  880    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  33.1 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  33.48 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  28.68 
 
 
447 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  35.77 
 
 
443 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  29.55 
 
 
454 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  24.15 
 
 
614 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  27.18 
 
 
584 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  27.12 
 
 
572 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  24.73 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  20.9 
 
 
589 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  20.45 
 
 
600 aa  73.2  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  24.14 
 
 
659 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  23.58 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  23.47 
 
 
601 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  36.3 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  30.14 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  24.25 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>