22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2436 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  895    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  74.83 
 
 		 446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  29.66 
 
 		 659 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  23.36 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  32.54 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  31.08 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  23.33 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  22.86 
 
 		 576 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  27.97 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  20.93 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  31.62 
 
 		 871 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  36.3 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  28.35 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  28.89 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  20.66 
 
 		 581 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  23.9 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  27.19 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  22.73 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  21.47 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>