47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1536 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  100 
 
 		 584 aa  1206    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  49.16 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  47.29 
 
 		 584 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  35.96 
 
 		 614 aa  346  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  28.88 
 
 		 659 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  30.81 
 
 		 600 aa  227  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  26.26 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  27.74 
 
 		 576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.34 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  26.41 
 
 		 443 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25 
 
 		 611 aa  87.8  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  25.54 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  25.29 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  25.68 
 
 		 447 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  22.61 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  25.27 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  21.79 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.05 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  23.34 
 
 		 871 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.89 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  22.7 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  27.48 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  23.34 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 804 aa  63.5  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  22.75 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  22.62 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0169  hypothetical protein  28.21 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000510437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.39 
 
 		 549 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  24.13 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  23.31 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  23.39 
 
 		 549 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  22.17 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0650  hypothetical protein  22.74 
 
 		 371 aa  53.5  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  21.81 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.07 
 
 		 581 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  20.25 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  23.82 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  22.03 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  21.92 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  22.68 
 
 		 541 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  22.38 
 
 		 568 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  21.57 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  23.16 
 
 		 438 aa  44.3  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  21.89 
 
 		 589 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  20.59 
 
 		 546 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  21.7 
 
 		 543 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>