53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1585 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1585  batD protein  100 
 
 		 600 aa  1239    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  36.19 
 
 		 614 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  30.49 
 
 		 659 aa  266  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  30.59 
 
 		 589 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  31.15 
 
 		 584 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  30.12 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  27.34 
 
 		 572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  26.12 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  20.54 
 
 		 601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  27.8 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  22.43 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  28.41 
 
 		 443 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  23.61 
 
 		 576 aa  97.1  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.43 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  23.42 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  23.89 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  23.91 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23.81 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  20.45 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  23.77 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  22.36 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  22.66 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  27.97 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  25.81 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  20.31 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  23.21 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  30.22 
 
 		 871 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  27.01 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  24.68 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  21.67 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  21.93 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  21.03 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  23.45 
 
 		 581 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  21.3 
 
 		 543 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  21.24 
 
 		 549 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  22.04 
 
 		 386 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  21.03 
 
 		 549 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  20.97 
 
 		 544 aa  50.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  22.25 
 
 		 580 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  21.63 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  20.94 
 
 		 552 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  20.53 
 
 		 544 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  20.16 
 
 		 551 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  21.82 
 
 		 584 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  24.9 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  22.38 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  21.69 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  22.22 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  21.7 
 
 		 555 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  22.13 
 
 		 553 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  22.13 
 
 		 553 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>