30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0211 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  902    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  37.91 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  34.1 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  32.59 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  30.33 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  29.22 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  28.4 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  26.18 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  24.31 
 
 		 584 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  23.37 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  25.29 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  25.71 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 804 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  21.68 
 
 		 659 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  23.14 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  23.27 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  22.46 
 
 		 564 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  25.28 
 
 		 871 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  24.24 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  22.38 
 
 		 564 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  25.82 
 
 		 483 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  23.99 
 
 		 553 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  24.26 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  22.39 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  22.52 
 
 		 569 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  22.39 
 
 		 564 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  23.41 
 
 		 552 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  21.23 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  20.95 
 
 		 555 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 897 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>