56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1401 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  96.01 
 
 		 553 aa  1075    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  98.37 
 
 		 553 aa  1102    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  76.33 
 
 		 564 aa  854    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1122    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  76.51 
 
 		 564 aa  854    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  74.41 
 
 		 547 aa  831    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  76.33 
 
 		 564 aa  872    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  76.01 
 
 		 569 aa  857    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  85.53 
 
 		 555 aa  956    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  53.06 
 
 		 544 aa  594  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  54.35 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  55.14 
 
 		 544 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  53.76 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  52.53 
 
 		 548 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  52.69 
 
 		 586 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  47.45 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  34.06 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  38.39 
 
 		 584 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  37.74 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  32.38 
 
 		 555 aa  210  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  25.93 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28.65 
 
 		 551 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  29.38 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  28.71 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  27.27 
 
 		 568 aa  174  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.88 
 
 		 543 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  28.83 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.88 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  29.65 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.91 
 
 		 543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.27 
 
 		 543 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.85 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  28.52 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  25.5 
 
 		 548 aa  160  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.83 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  27.15 
 
 		 550 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.25 
 
 		 580 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.06 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  26.27 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  27.39 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.5 
 
 		 585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  28.24 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  28.46 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.38 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.29 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  23.16 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  22.22 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.26 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  23.76 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  28.23 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  21.38 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  21.18 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  21.53 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  27.42 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  23.78 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.87 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>