59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1523 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1186    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  55.02 
 
 		 544 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  49.23 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  50.94 
 
 		 564 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  49.66 
 
 		 547 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  51.44 
 
 		 564 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  51.01 
 
 		 569 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  51.85 
 
 		 553 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  47.11 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  51.27 
 
 		 564 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  52.69 
 
 		 552 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  51.24 
 
 		 553 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  52.04 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  45.74 
 
 		 544 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  47.38 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  41.67 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  40.79 
 
 		 581 aa  313  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  39.61 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  38.48 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  30.13 
 
 		 555 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  28.54 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  26.02 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  26.3 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.61 
 
 		 595 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  25.71 
 
 		 550 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  25.21 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  25.22 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.62 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  30.38 
 
 		 580 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  25.88 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.13 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  28.29 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  25.79 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.82 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  24.65 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  27.66 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.42 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  27.8 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.33 
 
 		 544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  25.49 
 
 		 585 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  26.94 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.7 
 
 		 570 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  25.66 
 
 		 566 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  25.3 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  25.45 
 
 		 589 aa  114  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  24.37 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  25.76 
 
 		 871 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  22.51 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  21.9 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  25.16 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  24.42 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  29.69 
 
 		 438 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  25.25 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  20.15 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  21.9 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  22.09 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  27.98 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>