59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2432 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1111    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  56.1 
 
 		 548 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  54.95 
 
 		 544 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  53.83 
 
 		 547 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  52.73 
 
 		 544 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  52.36 
 
 		 564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  54.64 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  54.23 
 
 		 555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  53.85 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  53.76 
 
 		 552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  54.23 
 
 		 564 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  52.83 
 
 		 564 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  53.48 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  52.09 
 
 		 544 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  57.61 
 
 		 586 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  44.4 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  34.44 
 
 		 581 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  33.28 
 
 		 584 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  37.2 
 
 		 586 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  27.61 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  26.63 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  32.05 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  32.03 
 
 		 580 aa  191  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  28.21 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  28.92 
 
 		 550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  29.91 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.73 
 
 		 543 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.5 
 
 		 548 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.46 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.76 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.07 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.85 
 
 		 566 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  28.9 
 
 		 543 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  28.01 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.96 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  27.91 
 
 		 595 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.57 
 
 		 546 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.83 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  26.87 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.83 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  28.11 
 
 		 570 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  28.32 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  27.03 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  25.82 
 
 		 571 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  26.94 
 
 		 589 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25.94 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  23.09 
 
 		 572 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  21.75 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  23.68 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  27.31 
 
 		 454 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  22.86 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  30.08 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  26.51 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  23.4 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  24.09 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  23.13 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  22.05 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  20.59 
 
 		 584 aa  43.9  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  25.58 
 
 		 389 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>