40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1207 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  31.15 
 
 		 447 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  31.49 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  29.44 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  28.23 
 
 		 546 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  28.29 
 
 		 543 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  29.87 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  29.49 
 
 		 544 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  28.36 
 
 		 543 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  28.25 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.44 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  25.75 
 
 		 543 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  25.75 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  22.31 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.04 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.58 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  23.7 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  24.71 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  24.91 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  23.64 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  25.1 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  22.39 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.93 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  24.82 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  25.26 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 589 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  27.31 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  24.14 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  20.9 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  23.53 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  22.09 
 
 		 586 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24 
 
 		 548 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  23.98 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  20.12 
 
 		 584 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.18 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  22.17 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  22.18 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  22.41 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  22.37 
 
 		 544 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>