33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3282 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  98.1 
 
 		 386 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  755    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  40.34 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  35.59 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  35.86 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  33.24 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  35.67 
 
 		 426 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  37.13 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  37.66 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  35.78 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  29.64 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  26.7 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.24 
 
 		 543 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.73 
 
 		 566 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  28.18 
 
 		 586 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.73 
 
 		 580 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.94 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.11 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  21.63 
 
 		 600 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  23.22 
 
 		 584 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.4 
 
 		 541 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.07 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  25.08 
 
 		 546 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  22.14 
 
 		 589 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.98 
 
 		 544 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  23.43 
 
 		 585 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  23.9 
 
 		 570 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.01 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  22.22 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  29.69 
 
 		 572 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.88 
 
 		 549 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>