44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1010 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  83.29 
 
 		 399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  55.88 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  57.5 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  53.92 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  56.79 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  37.8 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  34.31 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  37.54 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  25.56 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25.48 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.68 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  25.41 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.69 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  26.67 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  25.09 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.36 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  27.73 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  25.48 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.75 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  26.42 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  25.76 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.14 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  25.21 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25.83 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  22.83 
 
 		 570 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.28 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  25.49 
 
 		 595 aa  53.9  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  25.46 
 
 		 548 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  29.84 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.48 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  22.48 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.22 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  19.84 
 
 		 555 aa  46.6  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  24.15 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  21.72 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  21.99 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  20.91 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  21.07 
 
 		 569 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  21.07 
 
 		 564 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  24.19 
 
 		 544 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  21.86 
 
 		 564 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>