55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1622 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1105    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  66.91 
 
 		 548 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  54.95 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  54.03 
 
 		 544 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  54.24 
 
 		 564 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  55.38 
 
 		 547 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  53.99 
 
 		 544 aa  594  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  54.59 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  55.22 
 
 		 553 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  55.83 
 
 		 553 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  54.06 
 
 		 564 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  55.14 
 
 		 552 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  58.08 
 
 		 569 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  53.71 
 
 		 564 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  49.23 
 
 		 586 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  44.26 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  35.54 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  37.16 
 
 		 584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  39.79 
 
 		 586 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  33.77 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  27.5 
 
 		 548 aa  186  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  28.34 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  26.85 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.53 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  28.89 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  28.28 
 
 		 568 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  27.83 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.1 
 
 		 595 aa  173  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  28.3 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  28.11 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  27.17 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.7 
 
 		 580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  27.13 
 
 		 543 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.13 
 
 		 546 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.85 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  26.67 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25.98 
 
 		 541 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.73 
 
 		 544 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.73 
 
 		 566 aa  143  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.39 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  28.91 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  23.46 
 
 		 585 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.02 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  25.79 
 
 		 589 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  22.67 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  22.38 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  29.79 
 
 		 458 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  24.77 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  24.47 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  20.69 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.28 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  23.94 
 
 		 871 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  18.11 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  22 
 
 		 600 aa  43.5  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>