57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001267 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001267  BatD  100 
 
 		 548 aa  1119    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  68.61 
 
 		 548 aa  803    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  39.12 
 
 		 550 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  31.77 
 
 		 568 aa  270  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  27.61 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  26.81 
 
 		 548 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  27.58 
 
 		 544 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  28.79 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  28.34 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  26.51 
 
 		 555 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  26.49 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  25.99 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  25.93 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  25.95 
 
 		 569 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  25.55 
 
 		 564 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  24.95 
 
 		 564 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25.15 
 
 		 564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  26.24 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.91 
 
 		 551 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.3 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.3 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  27.5 
 
 		 584 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.71 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  26.34 
 
 		 540 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  26.79 
 
 		 581 aa  150  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  26.33 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  24.91 
 
 		 541 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  24.6 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  24.58 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.42 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  24.91 
 
 		 543 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  22.71 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  25.41 
 
 		 586 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  24.86 
 
 		 549 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  22.63 
 
 		 544 aa  134  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  24.68 
 
 		 549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  24.62 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  24.24 
 
 		 580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  27.41 
 
 		 570 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23.88 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.57 
 
 		 611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  24.81 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  23.52 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  21.23 
 
 		 589 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  26.42 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  24.19 
 
 		 363 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.75 
 
 		 447 aa  50.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.12 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  23.75 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25.19 
 
 		 476 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  21.63 
 
 		 589 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  26.12 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.68 
 
 		 475 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.19 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  20.82 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  22.54 
 
 		 572 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>