33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4530 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  54.08 
 
 		 451 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  36.16 
 
 		 447 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  33.75 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  34.27 
 
 		 436 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  29.04 
 
 		 458 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  28.95 
 
 		 414 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  29.48 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  23.21 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  21.45 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  23.71 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  22.39 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  20.47 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  25.96 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  24.19 
 
 		 581 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  21.18 
 
 		 544 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  25.22 
 
 		 546 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24.19 
 
 		 548 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  23.83 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  27.7 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  22.82 
 
 		 543 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  23.44 
 
 		 555 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  22.74 
 
 		 544 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  26.46 
 
 		 595 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  22.46 
 
 		 541 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  19.7 
 
 		 549 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  19.9 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.28 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  22.38 
 
 		 546 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  24.76 
 
 		 584 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  23.55 
 
 		 544 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  20.97 
 
 		 543 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  23.39 
 
 		 548 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>