61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3803 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  41.2 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  35.28 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  37.14 
 
 		 363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.94 
 
 		 458 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  34.38 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  29.14 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  27.13 
 
 		 595 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  24.89 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  27.12 
 
 		 475 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  23.39 
 
 		 543 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  26.5 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25.52 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.6 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  23.99 
 
 		 544 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  25 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  23.12 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  25.16 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  29.48 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  23.09 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.38 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.36 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  26.12 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  22.89 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  25.33 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  22.55 
 
 		 570 aa  73.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  27.36 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.37 
 
 		 551 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  23.81 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  23.31 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  26.81 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  25.61 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  22.53 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  24.94 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  23.96 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  25.73 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  24.86 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  25.27 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  24.65 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  24.86 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  22.71 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  29.72 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23.58 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  24.12 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  22.22 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  22.08 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  18.21 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  21.9 
 
 		 548 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  24.02 
 
 		 547 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  24.61 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  31.67 
 
 		 572 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  24.1 
 
 		 555 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  21.21 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  22.38 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  26 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  20.24 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  25.5 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>