54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000304 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000304  BatD  100 
 
 		 438 aa  903    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  41.94 
 
 		 472 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  41.33 
 
 		 476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  41.51 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  30.13 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  27.81 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.89 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  28.02 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  26.07 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.23 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  29.34 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  25.96 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  24.81 
 
 		 546 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.04 
 
 		 611 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.06 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  24.8 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  22.39 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  24.23 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  25.41 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  26.42 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  22.92 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.27 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  20.19 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.45 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  21.9 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.11 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  23.97 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  31.4 
 
 		 544 aa  57  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  22.83 
 
 		 549 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.34 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25.93 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  20.8 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  22.05 
 
 		 549 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  26.7 
 
 		 547 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  30.58 
 
 		 564 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  23.66 
 
 		 581 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  29.23 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  25.7 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  32.62 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  34 
 
 		 555 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  29.75 
 
 		 564 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  29.75 
 
 		 569 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  24.16 
 
 		 589 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  26.79 
 
 		 584 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  29.69 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  28.23 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  28.23 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  28.95 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  28.23 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  28.23 
 
 		 555 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  30.08 
 
 		 546 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  23.16 
 
 		 584 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  24.79 
 
 		 548 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>