54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0569 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  90.74 
 
 
472 aa  839    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  971    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  94.33 
 
 
475 aa  872    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  41.33 
 
 
438 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  25.24 
 
 
465 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  25.11 
 
 
414 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  26.01 
 
 
595 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25.52 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.02 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.51 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  28.72 
 
 
552 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.27 
 
 
566 aa  79.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  30.11 
 
 
543 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  30.11 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  28.27 
 
 
546 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.78 
 
 
543 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.78 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  24.57 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  27.81 
 
 
544 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  27.88 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  23.91 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  24.4 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.78 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  20.78 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  23.27 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  24.77 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  25.97 
 
 
580 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  27.32 
 
 
549 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  21.46 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  24.75 
 
 
584 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.32 
 
 
549 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  30.37 
 
 
581 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  28.33 
 
 
544 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  22.89 
 
 
436 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  29.17 
 
 
548 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  22 
 
 
586 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  24.07 
 
 
547 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  25.47 
 
 
589 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.47 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  25.19 
 
 
548 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  28.23 
 
 
553 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  27.97 
 
 
426 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  25 
 
 
550 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  27.42 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  27.42 
 
 
552 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  24.18 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  23.33 
 
 
564 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  22.92 
 
 
564 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  23.58 
 
 
569 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  23.58 
 
 
564 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  26.32 
 
 
544 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  26.67 
 
 
430 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  24.17 
 
 
555 aa  43.5  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  28.57 
 
 
586 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>