35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3053 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.86 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  33.58 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  34.27 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  29.12 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  29.48 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  27.8 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  22.92 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.24 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  27.31 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  27.07 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  35.92 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  25.73 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.18 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  23.98 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  28.64 
 
 		 541 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  33.01 
 
 		 551 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  30.22 
 
 		 544 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  22.94 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  22.86 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  23.53 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  23.6 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.87 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  23.53 
 
 		 570 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  23.58 
 
 		 589 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  23.35 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.35 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  23.75 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  21.78 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.14 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.47 
 
 		 581 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.38 
 
 		 544 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  23.94 
 
 		 611 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  22.46 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>