53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2817 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1131    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  32.2 
 
 		 544 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  31.47 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  30.98 
 
 		 569 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  30.75 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  31.21 
 
 		 564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  30.42 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  31.03 
 
 		 547 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  29.63 
 
 		 553 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  30.37 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  30.88 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  30.44 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  30.65 
 
 		 544 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  29.57 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  28.74 
 
 		 581 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  30.13 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  27.94 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  30.89 
 
 		 546 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  28.16 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  32.78 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  27.59 
 
 		 568 aa  183  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  27.15 
 
 		 550 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  26.48 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  26.22 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.96 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  24.63 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25.51 
 
 		 544 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.98 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.6 
 
 		 543 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  28.07 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  25.92 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.65 
 
 		 543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  27.51 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.51 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.4 
 
 		 543 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  24.84 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.15 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.83 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  29.89 
 
 		 580 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  23.29 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.19 
 
 		 611 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  22.47 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  22.4 
 
 		 585 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  20.51 
 
 		 589 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  22.73 
 
 		 571 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  22.92 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  20.98 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  29.45 
 
 		 438 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.19 
 
 		 458 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  23.05 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.1 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  30.25 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  24.17 
 
 		 476 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>