47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3384 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  90.95 
 
 		 472 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  94.33 
 
 		 476 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  41.51 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  27.02 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  26.29 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  27.12 
 
 		 447 aa  87  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  26.01 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  25.31 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.27 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.51 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  25.68 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  29.19 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  28.72 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  25.68 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  28.27 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  29.19 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.87 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  28.63 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.34 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  24.43 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  24.4 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  24.89 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  22.75 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  24.68 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  24.18 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  24.75 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  25.19 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.32 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  27.32 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  21.46 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  28.28 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  22.11 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  21.82 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.47 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  25.9 
 
 		 544 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  27.97 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  25.68 
 
 		 548 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  25.35 
 
 		 589 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  27.5 
 
 		 548 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  26.57 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  29.08 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  23.79 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  25.87 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  27.5 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  25.87 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  25.76 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>