44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5136 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  34.76 
 
 
447 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  32.74 
 
 
451 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  33.75 
 
 
363 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.82 
 
 
458 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  31.58 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  31.68 
 
 
436 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  28.81 
 
 
424 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  25.96 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.14 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  26.67 
 
 
476 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.29 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  23.1 
 
 
546 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  22.54 
 
 
544 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  24.67 
 
 
543 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.68 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  21.43 
 
 
544 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  23.36 
 
 
551 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.36 
 
 
611 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  26.96 
 
 
589 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  22.19 
 
 
546 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  22.89 
 
 
544 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  24.85 
 
 
595 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  21.02 
 
 
543 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  21.26 
 
 
543 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  21.79 
 
 
549 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  24.1 
 
 
547 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  21.85 
 
 
549 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  20.87 
 
 
548 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  22.94 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  20.69 
 
 
570 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  20.98 
 
 
584 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  20.42 
 
 
544 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  21.66 
 
 
553 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  21.71 
 
 
553 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  21.18 
 
 
552 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  23.38 
 
 
555 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  18.11 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  26.05 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  21.08 
 
 
586 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  23.97 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0868  hypothetical protein  23.97 
 
 
440 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  21.43 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  24.53 
 
 
568 aa  43.1  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>