52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05142 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001267  BatD  68.61 
 
 
548 aa  803    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1125    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  37.71 
 
 
550 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  34.18 
 
 
568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  26.1 
 
 
548 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  27.5 
 
 
544 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  26.5 
 
 
546 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  26.37 
 
 
544 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  28.32 
 
 
544 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  26.51 
 
 
555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  26.04 
 
 
564 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  25.96 
 
 
553 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  25.4 
 
 
547 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  26.46 
 
 
553 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  25.84 
 
 
564 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  27.3 
 
 
586 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  25.5 
 
 
552 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  25.45 
 
 
564 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  25.4 
 
 
569 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  27.98 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  24.08 
 
 
540 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  24.18 
 
 
551 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  24.82 
 
 
543 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  23.94 
 
 
544 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  24.59 
 
 
552 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  25.17 
 
 
584 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  24.45 
 
 
543 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  23.53 
 
 
541 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  27.09 
 
 
570 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  22.79 
 
 
546 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  25 
 
 
586 aa  130  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  21.72 
 
 
546 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  22.22 
 
 
543 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  25.2 
 
 
555 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23.34 
 
 
566 aa  120  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  23.03 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  23.23 
 
 
549 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.23 
 
 
549 aa  116  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  24.14 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  22.36 
 
 
595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  26.96 
 
 
611 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  20.72 
 
 
544 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.56 
 
 
585 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  23.83 
 
 
571 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  22.01 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  26.47 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  25.38 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  28.95 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  26.47 
 
 
475 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  26.47 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  23.57 
 
 
451 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  26.49 
 
 
424 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>