61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3095 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  74.78 
 
 		 564 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  74.87 
 
 		 564 aa  832    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  85.38 
 
 		 553 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  86.1 
 
 		 553 aa  963    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  73.94 
 
 		 569 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  85.53 
 
 		 552 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  74.96 
 
 		 564 aa  851    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  73.1 
 
 		 547 aa  808    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1122    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  55.61 
 
 		 544 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  56.13 
 
 		 544 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  54.59 
 
 		 544 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  52.85 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  54.23 
 
 		 546 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  51.01 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  46.92 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  34.32 
 
 		 581 aa  313  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  38.2 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  36.53 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  31.94 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  26.51 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  28.73 
 
 		 568 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  28.83 
 
 		 595 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  29.31 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.51 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 544 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  28.04 
 
 		 543 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  28.04 
 
 		 543 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  28.54 
 
 		 546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.42 
 
 		 543 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.87 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.07 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.54 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  26.2 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  27.04 
 
 		 551 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.94 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  27.93 
 
 		 550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  27.61 
 
 		 570 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.22 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  27.29 
 
 		 544 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  25.61 
 
 		 585 aa  134  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  26.83 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  26.39 
 
 		 566 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.31 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  28.02 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  27.84 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  23.32 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.43 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  22.78 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  28.23 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  20.06 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  21.93 
 
 		 614 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  24.18 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  25.6 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  24.05 
 
 		 414 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  23.79 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  19.84 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  23.38 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  30.71 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  22.94 
 
 		 871 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  19.66 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>